Sujet de stage :
Assemblage du ribosome - étude par mesure de force sur molécules uniques

Nous avons mis au point un double piège optique permettant de mesurer en continu la force nécessaire pour dérouler réversiblement une molécule d’ARN, en présence ou en l’absence de protéines reconnaissant cet ARN. L’étude d’un système modèle caractérisé par nos collaborateurs biologistes à l’IBPC – l’interaction de la protéine ribosomique L20 avec son ARN cible - montre que cette force, qui reflète fidèlement la structure secondaire de la molécule, est fortement altérée par la présence de la protéine. On peut en déduire deux types d’information: (1) l’effet des protéines sur l’énergie des appariements entre bases, une information difficile à obtenir autrement. (2) la localisation, à 2-3 bases près, de la position des protéines sur la structure d’ARN. Nous souhaitons maintenant appliquer cette approche nouvelle à des problèmes biologiques plus complexes, comme, par exemple, l’ordre d’assemblage des protéines d’une région du ribosome. Travaillant avec un postdoc du laboratoire de Nanobiophysique, le stagiaire sera amené à

• Apprendre la technique de mesure de force par piège optique
• Apprendre la manipulation de molécules d’ARN et de protéines
• Préparer et effectuer les mesures de force à l’échelle de la molécule unique
• Analyser les résultats

Il s’agit d’un stage essentiellement expérimental qui pourra déboucher sur un travail de thèse de doctorat.